盡管試圖開發(fā)一種相對簡單，廉價的方法，以使醫(yī)生及其膀胱癌患者更好地了解可能的結局和最佳治療方案，但科學家們發(fā)現(xiàn)，為此而設計的先進的新分型技術無法提供比長期病理更好的信息。測試。

他們研究了肌肉浸潤性膀胱癌患者的幾組癌癥標本數(shù)據(jù)，這是一種與高死亡率相關的高度癌癥。數(shù)據(jù)集包括用于確定新興的分子亞型的數(shù)據(jù)集，并具有關于患者的結局信息。

他們一致地發(fā)現(xiàn)，目前提供給患者的膀胱腫瘤的分子亞型在病理學家長期使用的將癌癥定性為低或高級別并確定其侵襲到膀胱壁的程度的標準測試中表現(xiàn)要好。他們在一項圍繞《泌尿外科雜志》封面刊登的研究中進行了報道，包括脂肪，淋巴結，血管及其周圍的脂肪。

奧古斯塔大學喬治亞大學醫(yī)學院生物化學與分子生物學系主任Vinata B. Lokeshwar博士說：“肌肉浸潤性膀胱癌具有侵襲性，通常預后很差。”“每個人都在嘗試找出如何改善診斷，治療和生存的方法。”

該研究的通訊作者，Lokeshwar表示：“對患者腫瘤進行基因特征分析絕對有價值，可以使您發(fā)現(xiàn)生長和轉(zhuǎn)移的驅(qū)動因素，從而幫助指導該患者的治療，即使這有助于確定新的治療目標。”佐治亞癌癥中心。“但是利用這些信息將腫瘤亞型化似乎并沒有增加對患者的診斷或預后價值。”

相反，研究人員建議在使用分子亞型來幫助指導患者護理之前，需要進行更多的研究。

不斷發(fā)展的診斷方法包括根據(jù)癌癥類型中存在的基因表達和突變來匯編數(shù)據(jù)庫，以找到基因表達模式，然后將其用于“在病理學上相似但在分子上不同”的腫瘤亞型。這個想法是，分子亞型可以更好地指示哪些癌癥更具侵略性，并有助于指導治療選擇，例如在手術前去除患病膀胱的化學療法是否更好。

這是RNA測序或RNA-Seq，以及來自多種癌癥的聯(lián)邦遺傳材料數(shù)據(jù)庫，它使全球的研究人員能夠檢查特定腫瘤類型中的基因表達，以尋找與之相關的某些基因的共同表達。特定的臨床結果。首先確定了肌肉浸潤性膀胱癌的兩種亞型，即腔室預示著更好的生存和基礎型，預示著較差的預后，現(xiàn)在已經(jīng)出現(xiàn)了六種亞型。關于肌肉浸潤性膀胱癌亞型的第一篇論文發(fā)表于2014年《自然》雜志上。

但是，在尋找更簡單，更便宜，可廣泛獲得的測試以提供相似見解的過程中，研究人員發(fā)現(xiàn)，這些新興的亞型在通常的臨床參數(shù)(例如腫瘤的等級以及其擴散到淋巴結或血管)方面的表現(xiàn)要好。

他們的工作認真地開始了，由研究生Daley S. Morera和Sarrah S. Lahorewala對患者的數(shù)據(jù)集以及用于識別分子亞型的不同分類方法進行了詳盡的審查。

他們發(fā)現(xiàn)了11種在所有亞型分類方法中都通用的基因。他們認為，如果他們打算開發(fā)一種廣泛可用的測試，那么基于這些常見基因的亞型可能就足夠了。他們決定將他們的新子類型面板稱為MCG-1。

Lokeshwar說，他們沒有使用花費幾千美元的RNA-Seq，而是使用了價格不到10美元的現(xiàn)成的逆轉(zhuǎn)錄定量PCR方法，該方法還著眼于基因表達，實際上用于驗證RNA-Seq數(shù)據(jù)。

他們首先研究了自己的52例膀胱癌患者隊列，其中39例患有肌肉浸潤性疾病。他們發(fā)現(xiàn)MCG-1在預測重要指標(如轉(zhuǎn)移可能性)方面的準確度僅為31-36%;特定疾病的生存率，意味著尚存膀胱癌;或總體生存期，即從癌癥診斷或治療開始直至研究結束的所有死亡原因的生存期。

認識到他們使用的數(shù)據(jù)集相對較小并且他們沒有使用RNA-Seq進行分析，因此他們使用了癌癥數(shù)據(jù)庫ONCOMINE的三個患者數(shù)據(jù)集，其中有更多的患者-151名患有肌肉浸潤性膀胱癌的患者，并且還使用了RNA -Seq查看基因表達。