加州大學(xué)圣克魯茲基因組研究所(UC Santa Cruz Genomics Institute)與微軟(Microsoft)建立了合作伙伴關(guān)系，將幫助研究人員利用該公司的云計(jì)算平臺(tái)微軟Azure加速分析基因組信息。這項(xiàng)合作為基因組研究所提供了新的計(jì)算、數(shù)據(jù)存儲(chǔ)和分析能力，使研究人員能夠更容易地合作和共享信息，并加快科學(xué)發(fā)現(xiàn)的速度。

“基因組學(xué)越來越依賴大規(guī)模計(jì)算，這種合作關(guān)系使我們能夠?yàn)閹讉€(gè)重大項(xiàng)目做大量基于云的計(jì)算，”加州大學(xué)圣克魯茲分校(UC Santa Cruz)大數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)化基因組學(xué)中心(Center for Big Data in Translational Genomics)的助理主任、研究科學(xué)家Benedict Paten說。

Azure平臺(tái)將用于各種基因組學(xué)項(xiàng)目，UCSC的研究人員將在這些項(xiàng)目中幫助生物醫(yī)學(xué)社區(qū)在癌癥和其他疾病的診斷和治療中更有效地使用基因組信息。其中包括最近資助的加州兒童癌癥比較，該項(xiàng)目將使用基因組分析來幫助醫(yī)生識(shí)別對(duì)標(biāo)準(zhǔn)治療無效的加州癌癥兒童的有效治療方法;基因組研究所參與國際癌癥基因組聯(lián)盟，該聯(lián)盟正致力于生成50種不同腫瘤類型和亞型的基因組異常的綜合目錄;人類基因組變異圖譜項(xiàng)目旨在開發(fā)出一套完整的人類遺傳變異圖譜。

“UCSC基因組研究所是一個(gè)專注于推動(dòng)疾病靶向治療的一流基因組實(shí)驗(yàn)室，”微軟研究院(Microsoft Research)客戶端和云應(yīng)用主管道格·伯格(Doug Burger)說?！癆zure提供規(guī)模和效率，幫助研究所的研究人員管理大量基因組數(shù)據(jù)集，同時(shí)滿足嚴(yán)格的數(shù)據(jù)使用、安全和隱私要求?！?/p>

加州大學(xué)圣克魯斯基因組研究所的科學(xué)主任David Haussler說，與微軟的合作將加速該研究所在癌癥基因組學(xué)和其他領(lǐng)域項(xiàng)目的進(jìn)展?！拔④浀馁Y源可以對(duì)基因組學(xué)產(chǎn)生重大影響，”Haussler說?！八麄冇性朴?jì)算方面的專業(yè)知識(shí)，而我們有基因組學(xué)方面的專業(yè)知識(shí)，因此這種合作具有巨大的潛力?！?/p>

云計(jì)算為基因組學(xué)研究項(xiàng)目提供了許多優(yōu)勢(shì)，這些項(xiàng)目需要對(duì)大數(shù)據(jù)集進(jìn)行密集的計(jì)算分析。Paten說，商業(yè)云服務(wù)的靈活性意味著研究人員可以在任何給定的時(shí)間訪問他們需要的所有計(jì)算能力，因此他們可以更快地進(jìn)行分析。

他說:“共享計(jì)算資源比擁有計(jì)算資源更有效?！薄半S著基因組數(shù)據(jù)的數(shù)量呈指數(shù)級(jí)增長，利用商業(yè)云的規(guī)模是有意義的?！?/p>

2015年3月，美國國家衛(wèi)生研究院(National Institutes of Health, NIH)取消了此前對(duì)使用云系統(tǒng)存儲(chǔ)和分析人類基因組數(shù)據(jù)的限制，為滿足NIH數(shù)據(jù)使用和安全標(biāo)準(zhǔn)的云服務(wù)商業(yè)提供商與基因組研究社區(qū)合作掃清了道路。