一項用于確定術(shù)前化療或新輔助化療對乳腺癌基因組影響的研究的結(jié)果提供了兩個關(guān)鍵的見解。一個是治療前的發(fā)現(xiàn)，可以幫助預(yù)測哪些患者將從術(shù)前化學療法中受益最大，另一個是治療后的發(fā)現(xiàn)，可以闡明癌細胞如何在化學療法中生存。研究結(jié)果發(fā)表在臨床癌癥研究中。

SWOG癌癥研究網(wǎng)絡(luò)使這項工作成為可能。十年前，SWOG團隊啟動了一項創(chuàng)新試驗S0800，該試驗比較了HER2陰性，局部晚期或炎性乳腺癌患者術(shù)前進行的兩種20周化療方案。在這項研究中，腫瘤組織樣本是在化療前后采集的，并存儲在SWOG的生物樣本庫中，該庫對世界各地的科學家開放。

進行這項研究時，SWOG研究人員Lajos Pusztai醫(yī)師和Ryan Powles醫(yī)師均在耶魯大學癌癥研究中心進行研究。他們將樣品提交給整個外顯子組測序，這是一種實驗室技術(shù)，可對基因組的蛋白質(zhì)編碼區(qū)域進行分類，這是人類基因組的一小部分，稱為外顯子組。

在他們的研究中，Pusztai和Powles分析了S0800的29種治療前活檢標本，以識別DNA突變模式，然后查看治療后的化療反應(yīng)以查看是否出現(xiàn)任何模式。他們發(fā)現(xiàn)，那些被化學療法徹底根除的乳腺癌患者具有較高比例的DNA突變“特征3”，該特征表明DNA修復(fù)存在缺陷，并且可能是由BRCA等基因的損傷引起的。

“這是一個線索，” Powles說，他曾經(jīng)是耶魯大學Pusztai實驗室的博士生，現(xiàn)在是百時美施貴寶公司的研究人員。“醫(yī)生可以查看基因測試的結(jié)果，以了解哪些乳腺癌患者可能對新輔助化療反應(yīng)最佳，哪些患者可能需要其他或其他治療方案。”

對于其后處理分析，Pusztai和Powles僅能夠分析29種化學前和化學后樣品中的9種。那是因為治療殺死了如此多的腫瘤細胞，以至于大多數(shù)樣本都太小而無法檢查。但是，剩下的9個樣品非常適合研究化療耐藥性。SWOG小組發(fā)現(xiàn)在幸存下來的腫瘤組織中不存在單個基因或基因突變。相反，這些腫瘤細胞具有屬于兩個生物學途徑的突變-E2F Targets和G2M Checkpoint。這些途徑是共同作用以調(diào)節(jié)細胞生長的基因集，如果該過程出錯，則可能導致癌癥。

SWOG乳腺癌研究委員會主席，耶魯大學癌癥研究中心乳腺癌轉(zhuǎn)化研究主管Pusztai表示：“本文的重要意義在于，它表明，盡管每種癌癥都獲得了不同基因的突變，但受影響的基因并不是隨機的。” 。“在化學療法中幸存下來的癌細胞在各個水平上都有細胞生長調(diào)節(jié)的改變。因此，盡管基因可能不同，但是它們卻發(fā)揮了相同的作用。”