密西西比州斯塔克維爾市——密西西比州立大學(xué)的一名教員正在開發(fā)一種為大規(guī)模研究解鎖生物館藏的首創(chuàng)方法，該方法將補(bǔ)充世界各地博物館對(duì)館藏進(jìn)行數(shù)字化的努力。

密歇根州立大學(xué)生物科學(xué)助理教授和植物標(biāo)本館館長 Ryan A. Folk 正在使用 432,781 美元的國家科學(xué)基金會(huì)三年期贈(zèng)款，通過結(jié)合使用唯一對(duì)象標(biāo)識(shí)符、二維碼和公民科學(xué)家來自動(dòng)化數(shù)據(jù)收集過程，或者招募非生物學(xué)家?guī)椭鷶?shù)據(jù)采集。

“我們的目標(biāo)是為科學(xué)界創(chuàng)造一種資源，”Folk 說，他正在與佛羅里達(dá)大學(xué)、威斯康星大學(xué)麥迪遜分校和愛荷華州立大學(xué)的研究人員合作。MSU 生物科學(xué)系博士后研究員Carolina Siniscalchi 也參與了該項(xiàng)目。

新方法使用一個(gè)唯一的對(duì)象標(biāo)識(shí)符——隱藏在一個(gè)二維碼中——分配并物理地附在每張植物標(biāo)本館憑證上，并且對(duì)標(biāo)本進(jìn)行拍照，標(biāo)識(shí)符清晰可見。僅在植物界就有超過 250,000 個(gè)物種，F(xiàn)olk 表示，標(biāo)本材料的獲取和記錄是“耗時(shí)且容易出錯(cuò)的”。

Folk 是春季版《植物科學(xué)應(yīng)用》(Applications in Plant Sciences) 中的一篇論文的主要作者，該論文是系統(tǒng)發(fā)育學(xué)的旗艦出版物，是生物實(shí)體之間進(jìn)化關(guān)系的研究。APPS 是一份經(jīng)過同行評(píng)審的開放獲取月刊，重點(diǎn)關(guān)注所有植物科學(xué)領(lǐng)域的新工具、技術(shù)和協(xié)議，可作為 Wiley 在線圖書館的一部分。文章在線https://doi.org/10.1002/aps3.11410。

“使用二維碼系統(tǒng)，我們發(fā)布了一個(gè)系統(tǒng)，管理從植物標(biāo)本館到測序和數(shù)據(jù)分析的數(shù)千個(gè)樣本。作為紙質(zhì)文件，我們?cè)诖蠹s兩年內(nèi)用基因組數(shù)據(jù)覆蓋了 15,000 個(gè)物種，”Folk 說。“未來，我們希望所有此類館藏信息都可以在線獲取，方便查找，無需重復(fù)工作。”

“我們的工作流程基本上由幾種策略組成，這些策略可以讓您直接從走進(jìn)博物館一直到數(shù)據(jù)分析和發(fā)布，”Folk 說。“我希望我們的努力將啟動(dòng)以其他生物為重點(diǎn)的重大項(xiàng)目，并為種子植物固氮進(jìn)化枝的生物多樣性建立新的基線。”

土生土長的俄亥俄州阿克倫市，MSU 的 Folk 實(shí)驗(yàn)室使用基因組和生物信息學(xué)技術(shù)，使用各種植物群和棲息地從進(jìn)化和生態(tài)角度記錄植物多樣性的起源。他的工作基于密歇根州立大學(xué)的植物標(biāo)本室，收藏了來自世界各地的大約 35,000 個(gè)維管植物標(biāo)本，重點(diǎn)是東南部